Kompyuter kimyo
Ushbu kitob kimyo ta'limi va tadqiqot ishlarida kompyuter dasturlarining qo'llanilishi hamda ularning nazariy va amaliy jihatlarini o'rganishga bag'ishlangan. Unda kompyuter kimyosi, kvant-kimyoviy hisoblash usullari (yarim empirik, noempirik, DFT), molekulyar mexanika va dinamika, 2D va 3D strukturalarni chizish, kimyoviy reaksiyalarni modellashtirish, biologik faollikni baholash, YaMR va UB-spektroskopiya, atom zaryadlarini hisoblash kabi keng qamrovli mavzular yoritilgan. Shuningdek, kitobda turli dasturiy majmualardan (Gaussian, HyperChem, Avogadro, Mopac va boshqalar) foydalanish bo'yicha amaliy ko'rsatmalar va nazorat savollari berilgan.
Asosiy mavzular
- Kimyoda kompyuter kimyo va uning tarixi: Kompyuter kimyosining fan sifatida shakllanishi, uning rivojlanishi, ta'limdagi o'rni va elektron bazalari haqida ma'lumotlar.
- Hisoblashlarning empirik usullari: Molekulyar mexanika va molekulyar dinamika usullari, ularning nazariyalari, qo'llanilishi va misollar.
- Kvant-kimyoviy hisoblash usullari: Yarim empirik, noempirik va zichlik funksionali nazariyasi kabi hisoblash usullarining nazariy asoslari, qo'llanilishi va farqlari.
- Kimyoda qo'llaniladigan hisoblash majmualari: Gaussian, HyperChem, Avogadro, Mopac, ChemOffice va boshqa dasturlarning imkoniyatlari, ulardan foydalanish bo'yicha amaliy ko'rsatmalar.
- Kvant-kimyoviy hisoblash bayonnomalarini tuzish qoidalari: Tizim zaryadi, spin multipletligi, geometrik optimizatsiya algoritmlari va erituvchi ta'sirini hisoblash usullari.
- In Silico - birikmalarning biologik faolligini nazariy baholash usullari: PASS dasturi, QSAR/QSPR, molekulyar doking va virtual skrining usullari, ularning nazariy asoslari va qo'llanilishi.
- Amaliy ko'rsatmalar: Dastlabki geometriyalarni hosil qilish, yordamchi dasturlar, atom zaryadlari va spektrlarni hisoblash, reaksiyalarni modellashtirish va metalloorganik birikmalarni modellashtirish bo'yicha amaliy ko'rsatmalar.
- Kimyoviy tajribalar natijalarini baholash: Hisoblashlardagi xatolik turlari, ularni qayta ishlash, amaliyot uchun vazifalar va mavzularni mustahkamlash uchun testlar.